İlk İzmir'i kuranların; M.Ö. 3000'de Tunç Çağını yaşayan ve Bayraklı'da oturan bir halk olduğu, yapılan kazılar sonucu, anlaşılmıştır. Bayraklı; 6 Mart 2008 tarihinde ilçesi olmuş, ve 22 Mart 2008 tarihinde 26824 sayılı Resmi Gazetede yayımlanmıştır. Karşıyaka İlçesine bağlı iken, ilçe olan Bayraklı'da 2009 yerel seçimlerinden itibaren ilçe teşkilatı oluşturulmuştur.
İzmir'i oluşturan onbir ilçeden biri olan Bayraklı; İzmir kent merkezinde, İzmir Körfezi’nin kuzeydoğu köşesinde İzmir-Çanakkale asfaltı üzerinde yer alır. Yamanlar Dağ Grubu'nun güney yamaçlarını da içine alan Bayraklı'nın doğusunda Bornova İlçesi, batısında İzmir Körfezi ve Karşıyaka İlçesi, kuzeyinde Karşıyaka ve Bornova İlçeleri, güneyinde ise İzmir Körfezi ve Konak İlçesi bulunmaktadır. Bayraklı'nın yüzölçümü yaklaşık 3700 hektardır.
Akdeniz’e hakim olan denizciler İzmir’e gelip, bayrak açarak levent toplarlarmış. Gönüllüler levent olarak burada açılan bayraklar altında donanmaya katıldığı için yörenin adı yıllar içinde Bayraklı olarak kalır.
